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2020-07-28 clustalw

2020-07-28 clustalw

作者: YPCHEN1992 | 来源:发表于2020-07-29 10:34 被阅读0次

clustal

clustalw使用

# 安装
conda install -c bioconda clustalw
# 使用交互式
clustalw # 启动程序,按照指令选择输出和参数

clustalw format 输出格式

1:第一行 header line
2:允许空行
3:序列名和序列之间至少6个空格隔开,空格数取决于最长的序列名
4:比对块的最后一行无ID,是位点的保守性程度
     *-- match
    : -- conserved substitutions
    . -- semi-conserved substitutions
      -- no match

conserved-substitution

clustalw 输出

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