个体细胞中的多路RNA测序正在改变基础和临床生命科学，然而，通常组织必须首先分离，因此关于空间关系和细胞间通讯的关键信息就会丢失，现有的重组组织的方法为每个细胞分配了独立于其他细胞的空间位置，通过使用标记基因的空间表达模式(通常在这里不存在)，我们在很少或没有先验知识的情况下重新构建空间位置，通过搜索邻近细胞的转录谱通常比分离细胞更相似的序列细胞的空间排列，我们把这个任务制定为概率嵌入的广义最优传输问题，并推导出一个有效的迭代算法来解决它。我们重建的空间表达基因在哺乳动物肝脏和肠道上皮飞和斑马鱼胚胎部分从哺乳动物的小脑和整个肾脏,并使用重建组织识别基因空间信息因此我们识别一个组织原则的空间表达基因在动物组织中可以利用概率推断出有意义的空间位置的单个细胞。我们的框架工作可以合并priopr空间信息，并与任何单细胞技术相比较，其他原则，基础上的基因表达地图可以使用我们的方法来测试。
文献来源：https://www.nature.com/articles/s41586-019-1773-3?proof=trueMay
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