空间转录组文章逐步进入爆发期,单细胞方向的未来是单细胞空间组学,这篇文章利用空间转录组(ST)和原位杂交测序(ISS)研究阿尔茨海默症。
尽管科学家们在阿尔兹海默症(AD)的淀粉样斑块(Amyloid plaque)周围观察到复杂的类似炎症的变化,但对于此反应相应的分子变化和细胞相互作用知之甚少。研究人员利用空间转录组学,对AD小鼠模型中淀粉样斑块周围直径100μm的组织区域中发生的转录变化进行了探究。在此,研究人员证明了AD早期改变以基因共表达网络的富集髓鞘和少突胶质细胞基因(OLIGs)为特征,而在疾病后期,多细胞基因共表达网络中的斑块诱导基因(PIGs)则较为显著,其中涉及补体系统,氧化应激,溶酶体和炎症。研究人员通过小鼠和人脑切片上的原位测序证实了在细胞水平上观察到的大多数变化。全基因组空间转录组学分析为科学家们提供了一种前所未有的方法来揭示AD以及其他脑部疾病的致病标志附近的细胞网络失调。
文献来源:【PMID】32702314
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