人类表型本体(Human Phenotype Ontology, HPO)提供了人类疾病中遇到的表型异常的标准化词汇。Doc2Hpo是一个可以提取一段文字当中疾病表型的数据库。它主要是利用HPO数据库的当作背景。来查找文字当中有哪些疾病表型

输入
Doc2Hpo
的输入十分简单,就是一段 文本文字即可。这个可以是文章内容,同时也可以是文章的摘要什么的。看自己心情。
这个支持三种搜索格式:String Search; MetaMap Lite; NCBO Annotator

我们使用示例文件来进行下一步操作,输入文本后。我们点击submit
即可
输出
提交之后,就会把文字和HPO
数据库当中的条目进行匹配。来提取文本当中的疾病表型。

同时我们可以查看这些表型对不对。来进行人工的筛选

网友评论