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GWAS分析-说人话(16)- "一键提取“所有染色体需要的表型

GWAS分析-说人话(16)- "一键提取“所有染色体需要的表型

作者: 医学小蛋散 | 来源:发表于2020-08-14 16:36 被阅读0次

    前言

    这个其实是“GWAS分析-说人话(7)keep提取我们需要的表型数据 III”的续编IV

    没错,只要你的需求(daoshi)不是什么变态,

    一般都是要所有染色体都提取数据的。


    留意哦,简短粗暴:

    Terminal中发动for循环!~

    for ch in `seq 22`; do /Users/xxx/plink --noweb --file /Volumes/xxx/chr$ch --keep /xxx/你想要提取的文件.txt --recode --make-bed --out 你想要的文件名$ch; done

    是的,以上~

    进一步了解--keep功能,请到:

    1.GWAS分析-说人话(5)keep提取我们需要的表型数据 I

    2.GWAS分析-说人话(6)keep提取我们需要的表型数据 II

    3.GWAS分析-说人话(7)keep提取我们需要的表型数据 III

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