注：数据集是核酸序列； 1. fasta2paml； perl Gblocks2Paml.pl orthology...
先见教程：http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/MCMCtree.Tutor...
mcmctree估算物种分歧时间 https://www.biomart.cn/news/16/2908793.h...
树的构建 基因树 并联树 串联树 mcmctree建议使用氨基酸序列做
使用paml软件里的mcmctree功能需要phylip格式的比对结果,找了以下,发现用R包phylotools转...
推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种...
基因序列中的密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例进行替换，具有恒定的演化速率，因此两个物种时间的遗传距离与物种分歧...
准备文件： 1，化石标定的物种关系树 （参考已发表的文献） 改名为input.tree2，mcmctree.ctl...
看到一个可进行物种分歧时间估计的方法，是PAML中的一个子程序mcmctree。在此记录。 标题：PAML 4: ...
物种分歧时间估计的软件有： r8s[https://doi.org/10.1093/bioinformatics/...
本文标题：mcmctree
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/miercctx.html
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