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科学计算与绘图--python解决方案

科学计算与绘图--python解决方案

作者: 南博屹生物医学 | 来源:发表于2018-07-20 17:14 被阅读0次

    ​提到科学计算,可能大家马上就想到matlab、maple等,或者scilab、octave、R、gnuplot等开源的软件。

    这些软件各有其优缺点。然而,就算我们只需要其中某个功能,往往也需要耗费大量时间和精力去安装软件,并系统学习。统一语法成了众望所归。

    强大的python库,几乎能满足你所有的应用要求(有点夸张了),让你从此不再需要为了某种工具而学习其语法。各种库紧密围绕在python周围,共同编织美好的明天。

    科研离不开科学计算,写论文离不开数据可视化。下面列出了小博选用的python库,帮助你解决科学计算以及数据可视化这两个问题。

    python--优雅的编程语言 

    matplotlib--SourceForge最佳项目,python的2D绘图库 

    mayavi2--python的3D绘图库 

    sympy---python符号计算库numpy 和 scipy --python数值计算库

    简介

    1、numpy and scipy:numpy提供了矩阵和向量类,而scipy依赖numpy,它封装了科学计算的算法。简单的说,numpy提供对象,scipy提供了算法。

    2、matplotlib:绘图功能基本上可以与matlab媲美。它的特色是可以嵌入类似tex语言的数学公式,直接对图添加数学公式。

    这个功能很好地解决了想对图的标题添加上下标的问题。

    matlab绘图很方便,但选择matplotlib的一个重要原因是,matplotlib画的图很漂亮。可能是我matlab太差吧,同样是默认绘图参数,matplotlib绘制的图看起来就是舒服许多,曲线非常平滑,没有锯齿。

    matplotlib的文档和demo图都非常丰富。如果你要绘制二维图形,先到它网上去寻找一个漂亮的图,稍微修改一下代码,就能画出非常专业的二维图。

    3、mayavi2 :绘制的三维图非常好看,我第一次看到它绘制的向量场图,那种惊讶之状无法形容。

    4、sympy:符号计算库,函数名称类似maple。

    以上介绍的库的文档非常丰富,要学习它们只需要认真看文档就行了。它们文档结构很好,便于查找,临时抱佛脚可能效果也很显著,毕竟完成了任务就ok了。

    一个一个库去安装费时费力,已经有人将它们都集成到一起,比如python(x,y)。python(x,y)的语言环境类似matlab,主要面向科学家,使用起来非常方便,最重要的是它免费。网上有下载,google一下吧。

    小博发现python portable 软件也内置了许多库,可能是mayavi2体积太大就没包含它,但是已经够用了。

    你可以把它解压到U盘中,将它插到没有安装python的机器中照样可以运行python、画二维图.....。软件大概60多M,网上有下载,选择2.5版的下载。

    在生物医学领域,南博屹生物坚持做知识免费,与您为伴,让您在科研的道路上不孤单,科研因为你的坚持而有意义

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