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没错,你就缺一份这样详细的非编码RNA数据库

没错,你就缺一份这样详细的非编码RNA数据库

作者: 一只资源喵 | 来源:发表于2020-08-14 11:38 被阅读0次

    是不是发现

    Starbase貌似一直登录不上?

    是不是还在为

    非编码RNA的课题设计而发愁呢?

           小喵今天系统地把miRNAlncRNA以及circRNA所有最新的、实用的数据库整理了一下,下面给大家简单介绍一小部分,想要获得更多更详细的数据库资料,可以加小喵微信哦!

    1.miRNA数据分析工具

    miRBase:众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接。

    EVpedia:原核生物、非哺乳类真核生物和哺乳动物囊泡成分(蛋白质、mRNA、miRNA、脂质)的高通量分析数据。

    deepBase:功能注释了miRNAs, siRNAs,piRNAs, lncRNAs 以及 circRNAs。

    2.LncRNA数据分析工具

    NONCODE:拥有6个物种的527,336个lncRNA的信息。

    C-It-Loci:允许查询三个物种(人、小鼠、斑马鱼)组织特异性的lncRNA信息。

    TF2LncRNA:从ChIP-Seq数据中鉴定一列lncRNA基因的共同转录因子。

    看完上面介绍的这些数据库

    是不是有这样的感觉

    所以小喵给大家整理了一张以差异基因筛选→基因转录预测→蛋白结合能力预测→突变和预测→潜在调控功能预测→疾病关系为主线的一整套非编码RNA课题设计的路线图。

    想要路线图的朋友,可以动动手加小喵的vx:qfbiomed04

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