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随笔 | 我,农学研究生为什么要学生物信息?

随笔 | 我,农学研究生为什么要学生物信息?

作者: 生信石头 | 来源:发表于2023-02-26 22:32 被阅读0次

    刚给研究生(50+人)上完了第一节「园艺植物生物信息学实践」课程,效果良好。这或许要归功于过去这一年在授课讲演上的经验和思考。大体总结为一句话:讲演内容必须限制听讲者的认知范围之内。事实上,这个跟我们选择自学书籍是类似的,不同自学书籍可能适合不同的人。
    回到主题,为什么农学研究生要学生物信息?尽管这个问题已经不需要答案,因为就算你不想学,其他也都在学,所以你不得不学。但我仍然觉得这个话题可以用来水一个推文。
    1. 时代在召唤
    十年前,我还是研一的时候,你可以不知道生物信息,这个毫不影响的课题开展。逻辑上,也不会影响你对生物学研究的认知。但现在,环顾四周几乎找不到生物信息没有触及的地方。正如前面新冠疫情期间,各类病毒序列测序和演化分析,跑不了的就是生物信心。在植物学,或者说农学研究上,很难找到一份报道没有用到生物信息。或许是做全基因组关联分析GWAS,或许是做转录组数据分析RNAseq,更或者是比较基因组分析,又可能是ChIP-seq还是DAP-seq,Y2H-seq,Y1H-seq。跑都跑不了,不了解其中道道,很快就不知身边人在讨论什么。时代,不会为任何一个人停留。
    2. 农学就业困境
    农学,一般认为是难以就业。原因之一是你很难去度量一个农学生相对于一个经验丰富的农场管理人员或者农场负责人,优势在哪里?实践经验,根本无法比较。但基础知识,理论知识,理性思维和学习能力,这些或许才是问题。当前农学发展,无一不提及,大数据,自动化,智能化... 对于任何一个农学专业的学生,直接接触大数据的方式,可能就是学习生物信息。至少在一些数据的应用思维上,可以得到锻炼。同时,或许相关的技能锻炼,可以更多地理解「信息化时代」而非「刷短视频时代」或者「大数据杀时代」。
    3. 你需要挑战自己的极限
    各式各样的原因,导致农学方向的研究生,事实上计算机基础非常薄弱。逻辑上,生物学基础其实也不够好。生物信息正好要求这两点。简单来说,既要求有扎实的生物学知识,尤其是分子生物学只是,又要求有一定的计算机基础。无论哪一个方面,实际上都是让学习的人挑战自身极限。我们都很清楚有所谓「一万小时定律」,大体是你只要在某件事情上练习一万个小时,你就会变成这件事情的专家,但实际上,如果你只是跟人八卦「一万个小时」并不会让你成为八卦的专家,所以你想成为八卦的专家,应该去不断去想方设法获取八卦,无所不用其极得到几乎所有人都很难得到的八卦,你才会成为专家。而这个过程,就是不断去挑战自己获取信息的能力极限。于是回到主题,生物信息学习过程,就是挑战自身极限的过程。
    4. 你需要低成本高产出的能力
    生物信息,从某个方面来说,更贴近于计算机应用。研究生学业阶段结束后,或许你会具备各式各样的技能或者能力素质,但逻辑上,尤其是农学方面,真正要应用上能力,往往需要较高的投入。第一产业,无一不是重资产。而生物信息有一点点不同,这一项技能,或许就是唯一能具备的,纯靠自己就能组织生产并养活自己的能力。相比于IT出身,你的最大优势在于,你知道生物学问题是什么,开展农学应用的人,需要什么。这是思维的区别,存在不可替代性,所以并不需要担心。
    ....
    当然,还有很多,此处也不继续展开。
    总而言之一句话,「时代的大船,不会等你太久」。

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