<meta charset="utf-8">

函数与参数

1. 形式参数与实际参数

   image

2. 写函数的函数
   function() {}

补充知识：绘图函数 plot()

x = rnorm(10); plot(x)
plot(iris[,1], col = iris[,5])

image

简化函数：将变化的地方作为函数的参数，不变的地方作为函数的主体

3. 默认参数
   作者会设计很多参数，但只有前1-n个是必须填的，其他的的参数都有默认值。

   image

自己写一个小函数

题目：写一个函数，输入参数为一个数值型向量，输出结果为：该向量的“中位数”和“平均数”，并写出用户使用该函数的代码
我的答案

g <- function(z){
  x=mean(z),y=median(z))}
#Error in g(14) : could not find function "g"
function(变量)，函数默认输出一个数据，此题目输出的是两个数据，则构成向量输出，答案应如下

g <- function(x){
  print/return/c(mean(x),median(x))
}

tips: 有多个输出结果时，将输出的结果组成一个向量，可以用print/return;
当一个函数里需要返回多个值（比如有变量，有向量，有矩阵）时，我们要用list,而不是return

R包（R package）介绍

• R程序包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例
• 也有的R包只有数据，没有函数
• 包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等
• 特定的分析功能，需要用相应的程序来实现

R包来源

1. CRAN网站
   http://cran.r-project.org/web/views/
   install.packages()

2. Bioconductor
   http://bioconductor.org/
   BiocManager::install()

3. github
   http://github.com
   devtools::install_github()
   

   图片.png image

（国内）R包安装前需设置镜像

图片.png

• tools–global option-packages
• 代码设置

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#每次安装时运行一下

R包安装和使用的逻辑

(1)安装包-加载包-使用包里的函数

如报错：找不到函数，则加载函数所在的包，重试。

如报错：不存在叫xx名字的包，则安装xx包，重试。

library()是检查是否安装成功的标准

(2)已安装、不加载，直接使用

BiocManager::install()
dplyr::filter()

图片.png

常见疑问

1. 大片提示信息

检查是否有error，没有就忽略

2. packages not available

• 包名写错
• 安装命令使用错误
• 本机的R语言版本与包所要求的版本不符 (极少)

3. 是否更新

懒惰策略，能不更新就不更新，除非一直报错
不想回答：安装命令加参数：update = F, ask = F

4.加载A包，报错B包不存在

下载那个不存在的包…

5.报错中有connection或url

网络问题
切换镜像，检查网络连接。如果都没有问题，运行

options(download.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')

满分操作：判断式安装

if(!require(stringr))install.packages("stringr")

R包的使用场景

• 某流程代码中用到某些包
• 学绘图，用到ggplot2
• 别人的代码套自己的数据，报错不会改
• 大多数包里的函数规律一致，不需要单独学习，用到哪个函数学习那个函数
• 少数包的函数自有语法，例如ggplot2, dplyr等

R包如何使用-获取帮助

• 快速查看函数帮助文档

?max
help(max)

• 找R包介绍页面（CRAN或者Bioconductor）复制代码即可安装
• 少数R包有 Cheat sheet

R语言里的符号

() 函数
[] 向量、数据框取子集
[[]] 列表取子集
$ 数据框取列
= ,<- 赋值
== 判断是否相等
! 否定
{} 多行代码
井号# 注释
"" 字符串
:: 包::函数

认清函数与数据

函数
形式函数
实际函数
数据框或矩阵
列表
文件名
包

数据的读取

1.直接打开（wps）
2.记事本（win），文本编辑（mac)
3.sublime
4.R语言test=read.csv("文件名.csv")

读取后就是数据框，进行操作不会同步到原表格文件，建议另存，不要覆盖原文件

test = read.csv("ex3.csv")

• 常见分隔符：逗号 空格 制表符 (/t)
• 后缀名没有意义，只是人为定义的格式，约定俗成。在windows电脑上可以更好地绑定打开该文件的软件
• 本质都是纯文本

read.csv()#读取csv格式
read.table()#读取txt格式
#如果想读取text格式：另存为csv或者txt格式；专门函数的使用

直接读取如果失败，需要准备一些参数

R文件保存

图片.png
图片.png

save()
load()

Rproject组织形式

1. 脚本script .R
2. R文件数据 .Rdata/RData
3. 表格 .csv .txt