KEGG通路数据库将通路分成了7个大类,即代谢、遗传信息处理、环境信息处理、细胞过程、有机体系统、人类疾病、药物开发。见下图:
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每个大类里又分成若干子类,例如代谢通路就分成整体概览图、糖代谢、能量代谢、脂代谢、核苷酸代谢、氨基酸代谢等子类,见下图:
image通常用DAVID等工具是对KEGG的前6大类通路进行统计分析,得出一组基因富集的KEGG通路,给出通路的ID(如hsa00010) 和通路名字 (如Glycolysis/Gluconeogenesis)。知道通路属于的大类和小类,能帮助我们更好地解读通路富集的结果。但是在网页上去对照通路的类别,非常费时。如果有一张表,能够直接根据通路ID查询,就方便多了。
今天给大家送个福利,分享我最新整理的KEGG通路分类表。有了这张表,你只需输入通路的ID编号,即去掉物种信息(例如你获得的通路是hsa00010, 你就输入00010),就可以获取通路所属的大类和小类了。
下载地址
百度网盘:链接:https://pan.baidu.com/s/1U4yI-ahEdxXx_NLTy6JmRw 提取码:xp93
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