#当我们在谈论emo的时候,我们在谈论什么?#
别人咱不知道,也不敢问
而生物类研究僧
在踏入实验室的那一刻起
随时随地就能开始emo:
找不到选题会emo
PCR/WB没条带会emo
不会做数据分析会emo
“肝”paper/本子会emo
发际线后移会emo
....
# 拿什么来拯救你的科研emo?来来来,试试国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),从选题、数据分析到存数据发文章全方位帮你对抗emo!
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)选题:高效找文献、找数据
不论是研一萌新选题还是"青椒"写本子都需要做文献综述和调研前期研究的数据,这个时候CNGBdb可以帮你轻松找到需要的文献和数据。
找文献
除了常规文献搜索功能,例如使用关键词搜索获得文章的基本信息、全文链接、影响因子、引用量、被引文献和关联数据等。CNGBdb还设置了:
1. 关键词中英文智能识别搜索模式,即你可以用中文关键词搜索到英文文献。
2. 文献推荐图谱功能清晰呈现了该文献所属领域的经典文献、重要作者、科研关键词及相互之间的脉络,尤其在做文献综述的时候,让你以最少的时间成本获取最多的信息。
操作指引:CNGBdb首页 → 搜索框输入关键词 → 文献库查看文献找数据
除了常规的数据搜索功能,例如使用关键词搜索基因、蛋白、变异等数据,CNGBdb还整理和收录了植物、动物、微生物、疾病等方向的数据集和科学数据库,方便相关领域研究者查找和使用相关数据。
多领域组学数据集(部分) 操作指引:CNGBdb首页 → 导航栏 → 数据资源 → 数据广场 科学数据库(部分) 操作指引:CNGBdb首页 → 导航栏 → 科学数据库“干实验”:生信0基础也能上手
在这个“干湿结合”的时代,被安装包和代码劝退的生信0基础的同学,CNGBdb为大家准备了一大波在线分析工具,包括常用的比对工具BLAST,翻译组分析工具Galaxy,癌症数据分析平台DISSECT,病原数据库PVD,生命大数据可信计算平台CODEPLOT等。
其中,生命大数据可信计算平台CODEPLOT是一个灵活、可信的计算平台,用户无需任何编程背景,也可使用该平台的计算工具进行自动化的生物信息学分析。同时,它采用区块链和多方安全计算等前沿技术,确保用户的数据安全。
也就是说生信小白不再需要按部就班地安装Linux/R 包、学习各种语言、找数据,也可以徒手完成各种数据分析,包括单细胞、WGS、GWAS等;而生信达人也可以使用Jupyter Notebook在线交互式编程,一边写代码,一边调试修改。不论你是生信小白还是生信达人都可以在保障数据安全的情况下,轻松完成“干实验”。
生命大数据可信计算平台CODEPLOT为用户提供可信计算环境+多元化工具集+个性化工作空间+开放式数据资源。操作指引:CNGBdb首页 → 导航栏 → 计算发文章:便捷、快速存数据
来到发文章的高光时刻,是不是为了数据递交心力交瘁:研究英文指引的上传流程、上传速度一言难尽、中途遇到问题官方回复遥遥无期...
CNGBdb的『存数据』模块国家基因库序列归档系统(CNSA)帮你解决数据递交过程的各种问题:中英双语界面,上传流程清晰简洁;Aspera命令行数据上传,实现快速、批量数据上传;专属团队解决数据上传的各种问题。同时CNSA在生物安全、信息安全、物理安全三方面为存储的数据提供三重安全保障。截至2021年11月9日,CNSA已支持论文发表344篇,发表期刊182种,包括The Lancet、Science、Cell等。
CNSA遵循国际通用的组学数据标准,支持项目、样本、实验/测序、组装、变异、代谢、单细胞、序列等多种数据类型的在线、批量递交。其数据递交服务可作为文献出版流程的补充,支持早期数据的共享。操作指引:CNGBdb首页 → 导航栏 → 数据提交# 今天你emo了吗?动动手指,用CNGBdb解决你科研过程中的各种问题。
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