xcode8 The application does not

在我们项目中xcode8真机运行的时候总是出现The application does not have a valid signature.

基本出现的规律是在不修改配置情况下第二次真机运行出现。
找到的几种解决办法：
1.clean：有效一次，如果每次运行都先clean严重影响效率
2.删除手机上的程序：有效一次，但是如果程序里有数据每次都删除影响测试
3.修改证书配置：每次运行前修改一下证书的配置，再攺回来，可以有效一次，相对比较方便。

同样的情况，新创建一个demo不会出现，有可能和项目本身也有关系，有谁遇到过类似问题，有更好的解决办法么？