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大片段文库

大片段文库

作者: Peng_001 | 来源:发表于2020-06-11 21:36 被阅读0次
  • 大片段文库一般指片段长度1k以上的文库。

  • 测序机器是选择小段的片段测序的。(illumina 为150bp)

  • 文库构建是随机的。


大片段测序目的

  • 获取reads之间的物理距离关系

大片段测序问题

  • 无法PCR 太长的片段
  • 只测序很短的序列,合成大片段浪费

应对方式

对于这样的问题,illumina 测序采取了特别的方式。
相比于小片段文库序列,大片段序列会进行环化处理(并对末端进行生物素标记)。



接着会对这段环状片段再进行打断。

接下来的处理就和小片段处理类似了。


小/大 片段文库

  • 小片段文库read 为pairend,大片段文库read 为matepair。

  • 两条序列方向不同。


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