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选择性剪切分析软件rMATS 4.1.2安装

选择性剪切分析软件rMATS 4.1.2安装

作者: 小熊_wh | 来源:发表于2022-03-26 09:11 被阅读0次

rMATS是常用的选择性剪切(alternative splicing)分析软件。目前最新版是rMATS 4.1.2,已经可以通过conda安装,步骤如下:
第一步创建小环境rmats

conda create -n rmats -y
conda activate rmats

第二步,安装rMATS 4.1.2

conda install -c bioconda rmats

第三步进入到rMATS软件目录

cd ~/miniconda3/envs/rmats/rMATS

第四步测试rMATS

python rmats.py -h
image.png

第五步,查看版本

python rmats.py --version
image.png

至此,安装成功,下一步进行软件测试。

参考:详细介绍最新版可变剪接软件rMATS

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