rMATS是常用的选择性剪切(alternative splicing)分析软件。目前最新版是rMATS 4.1.2,已经可以通过conda安装,步骤如下:
第一步创建小环境rmats
conda create -n rmats -y
conda activate rmats
第二步,安装rMATS 4.1.2
conda install -c bioconda rmats
第三步进入到rMATS软件目录
cd ~/miniconda3/envs/rmats/rMATS
第四步测试rMATS
python rmats.py -h
image.png
第五步,查看版本
python rmats.py --version
image.png
至此,安装成功,下一步进行软件测试。
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