Linux 也是一个操作系统，和我们平常使用的windows、mac那些一样。 由于大多数生物信息分析的软件都是在 Linux 操作系统下运行的，所以学习生物信息的第一步就是从熟悉的windows等图形界面的操作系统过渡到熟悉使用Linux的一些基本操作。 此处应该注意对于Linux系统，我们需要的是“使用”，而不是“管理”或者“开发”这些。现有的网上搜索到的大多数 Linux 教程、书籍都是针对管理员和开发人员写的。 对于初学生信的我们来说过去复杂，这里整理归纳了一些目前我工作中常用的，在后续再对里面的命令详细阐述。
passwd：修改用户密码；
pwd：显示当前所在路径；
ls：列出当前目录里面的内容，可加上 -l -rt -h等参数，可以明确目录下都有什么文件，多大，权限如何等等详细的属性；
cd ：跳至指定目录，这里常用的cd命令有："cd -" 跳回上一次的目录，"cd .." 退回上级目录，“cd ~”跳回家目录；
目录管理相关命令：
mkdir：创建目录；
rm：删除文件或者目录；
mv：重命名文件或者目录；
chmod：修改文件或者目录权限；
文件查看相关命令：
cat：查看文件，并将内容输出到屏幕，但是对于大文件不适用，会看不清内容；
tac：和cat相反，是从尾到头查看文件并输出；
less和more：这两个是查看大型的文件比较合适的方式；
head -n：查看文件前n行；
tail -n：查看文件尾n行；
wc -l：计算文本文件的行数；
管道操作； cut；grep； awk； sed； sort；这几个比较复杂且重要，后续再详细展开说明用法。
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