生物信息学中常用的linux命令（三）

1. ps

语 法：ps x [-u <usrname>]
参 数：
-u <usrname> 显示usr用户的进程（默认显示自身用户进程）

2. top

语 法：top [-bcdu]
参 数：
-b 批处理模式，可以将top内容重定向到文件中
-c 显示详细信息
-d <n> 刷新时间间隔，n秒刷新一次
-u <usrname> 只显示usr用户的进程

3. jobs

功能说明：显示后台任务
语 法：jobs [-l]
参 数：
-l 显示任务进程ID

4. kill

参 数：
-num 通过num传递一个信号控制进程（默认15，终止进程），常用值如下
-9 强制删除进程
-19 暂停一个进程（使之处于T状态）
-18 继续暂停的进程
-l 显示信号列表

kill 9999 #终止进程号为9999的进程
kill -9 9999 #强制删除进程号为9999的进程
kill -19 9999 #暂停进程号为9999的进程
kill -18 9999 #继续进程号为9999的进程

5. history 查询该节点上执行过的历史命令

6. nohup 加到命令前使得该命令在用户退出登录后也能继续执行，一般与转后台’&’一起使用。

nohup sh test.sh &

7. & 加到命令结尾，使该命令在后台运行

sh test.sh &

8. 管道符 |

功能说明：将”|”前一部分的输出作为”|”后一部分的输入
语 法：command1 | command2

#显示file1的内容，将带有world的行输出，打印该行的第一列
less file1| grep world | awk ‘{print $1}’ 

前面介绍了生物信息分析过程中的一些常用linux命令，可以在WIN10下的linux子系统中进行操作练习，下一篇文章将会找一个RNA-seq的数据进行实战。