2019-06-09

实验记录7

1、#PBS -N cellrangercount

#PBS -q blade

#PBS -l nodes=1:ppn=4

#PBS -d /home/zhuqh/data/cellranger-3.0.2/

#PBS -j oe

date

cellranger count --id=0121 --fastqs=/home/zhuqh/data/01210122shuju/190201_A00682_0056_BHHNKDSXX --sample=LW-0121 --transcriptome=/home/zhuqh/data/cellranger-3.0.2/ovis3.1_genome  --nosecondary

date

写了这个作业在zhuqh上提交，不行。

2、人类下载的数据无法从fastq.gz格式gunzip解压缩，不知道为什么。