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ATRM:拟南芥转录调控图

ATRM:拟南芥转录调控图

作者: 科研星君 | 来源:发表于2021-02-22 20:34 被阅读0次

           转录因子(TFs)在发育和应激反应中均起关键作用。通过整合到原始系统中并重新连接原始系统,新的TF在转录调控网络的进化中发挥了重要作用。在这里,我们报告了一个高可信度的转录调控图谱,涵盖了拟南芥47个科的388个TF。。对该图的系统分析揭示了发育和应激反应子网的结构异质性,并确定了单细胞生物中缺少的三类新型网络基序,这对多细胞发育至关重要。而且,在植物着陆期间出现的新家族的TF具有更高的结合特异性,并且优先地连接到发育过程和这些新的网络基序中。TF的结合特异性和接线偏好之间进一步揭示的联系解释了新家族TF的接线偏好。这些结果揭示了新型TF的独特功能和进化特征,暗示了它们对多细胞生物进化的贡献的合理机制。

    https://academic.oup.com/mbe/article/32/7/1767/1017389

    工具:http://atrm.gao-lab.org/

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