Linux学习第二天-安装程序初阶

第一天学习Linux发现和它很有缘分，今天发现和anaconda也有不解之缘。。今天的主角是miniconda，就是anaconda的缩减版啊。。想当初我的windows10里面也有个miniconda。但是没用，都直接用的anaconda了…白天还和anaconda大战一场想要用它安装Rstdio。但是失败了，不晓得我的anaconda为何出现问题，前天刚重装一次。。真是郁闷啊。

我感觉我需要学一下排版。。。

压缩文件

首先第一步先检查，Linux里面是否含有解压缩文件，

bzip2

这个命令看起来和win的zip程序像亲戚。。不晓得是不是一个公司出品的
本以为需要安装，没想到这个win10搞的子系统居然自带，检测是否含有bzip2的方法

压缩程序的检查

如果出现的是上述图片这个样子，那就是有，那如果出现的是

bash:bzip2:command not found

不好意思没安装上
那就需要重新装咯

yum install -y bzip2

压缩文件可以用了就可以进行第二步了

anaconda的安装

小型的miniconda即可用于生信应用啦~
1.先进入要安装的目录中

cd biosoft

2.使用命令 wge下载miniconda

$ wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

这个.sh是脚本，wget是下载这个内容，将这个saving to后面的内容复制下来

输入wget之后的结果

这里面比较坑爹的是linux系统的复制和粘贴与windows的不同，选中之后单击左键为复制，单击右键为粘贴。

3.安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

bash就是安装脚本，回车之后进入到lincense反正也看不懂，也要用它,就一路ENTER就好，到回答的时候选择YES即可，然后继续敲回车，会问是否加入path继续敲yes
如图示

安装miniconda的回答
PATH路径的回答

最后的最后，是要激活它。。

输入source ~/.bashrc激活conda,命令行输入conda，如未报错则为成功

然后就是为了miniconda切换国内的源，不切换的话，那速度，比乌龟爬的都慢。常用的是清华源、科大源等等。

• conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
• conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
• conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
• conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

• conda config --set show_channel_urls yes

  
  切换源的图

4.conda的使用

• 查看列表

conda list

• 搜索软件

conda search 软件名

• 安装软件

conda install 软件名 -y

-y是自动安装
如果需要指定软件版本号输入

conda install 软件名 = 版本号 -y

• 卸载软件

conda remove 软件名 -y