EVAtlas：人类细胞外囊泡中ncRNA表达的综合数据库

活细胞释放的细胞外囊泡(EV)是信号转导和细胞通讯的重要载体，尤其是远距离细胞之间的相互作用。从内体系统分泌的外泌体和从质膜脱落的微泡(MV)是EV的主要来源，而EVs的内容物包括来自源细胞的多种生物分子，如脂质、蛋白质、代谢物、DNA和RNA。非编码RNA是EV中经过充分研究的重要分子，可以传递并调节靶细胞。因此，对ncRNA在EV中的分布进行全面调查，有助于了解EV的分子特征并揭示其中的潜在作用。

目前有一些数据库从EV的测序数据中深入评估了RNA的丰度，但大多数数据库在小样本量和ncRNA类型或非均匀表达谱方面存在局限性。为量化七种ncRNA类型（miRNA、snoRNA、piRNA、snRNA、rRNA、tRNA和YRNA）的表达谱，研究人员构建了一个用于EVs中ncRNA表达的综合数据库ECAtlas (http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVAtlas)，研究成果发表在知名期刊《Nucleic Acid Research》上。

EVAlats数据库首页

该数据库具有四个功能模块：(i)浏览和比较来自24种条件和8个来源（血浆、血清、唾液、尿液、精子、母乳、原代细胞和细胞系）的数据；(ii)根据其表达优先考虑条件相关组织中的候选ncRNA；(iii)探索24种条件下EV中特异性表达的ncRNA；(iv)研究ncRNA功能、相关药物、靶基因和EVs分离方法。

EVAtlas包含EV中最全面的ncRNA表达，将成为该领域的关键资源。

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参考文献

EVAtlas: a comprehensive database for ncRNA expression in human extracellular vesicles. Nucleic Acids Research. 2021