PMID：33728749
发表杂志：Journal of Cellular and Molecular Medicine
肿瘤研究中，时常碰到
在肿瘤组织中低表达，表达量与细胞分期、分级正相关，但是高表达预后差的基因，跟咱们的常识相违背，下面就来看看作者是怎么破这个局的？
先看下结论：
As a result, we speculated the up‐regulated CHAC1 in relatively higher malignancy or later stage of KIRC noticed in our research might be the feedback of high levels of GSH and further researches are still needed to reveal the function of CHAC1 in KIRC.
过表达CHAC1抑制细胞增殖，诱导细胞死亡。肿瘤晚期GSH水平显著增高，本研究中发现CHAC1在晚期ccRCC患者中高表达，很可能是对高水平GSH水平的反馈。
知识点
- TCIA: The Cancer Immunome Atlas, 肿瘤免疫集，包含TCGA的Predicted neoantigens数据。
- ESTIMATE：Estimation of STromal and Immune cells in MAlignant Tumour tissues
- TIMER：Tumor IMmune Estimation Resource
摘要
作者通过查阅文献发现，GSH在肿瘤组织中水平异常，而CHAC1与GSH关系密切，那么是否对肾透明细胞癌的预后有一定指导价值？针对这个问题，作者选择CHAC1作为文章的研究对象。临床特征相关性分析表明，CHAC1在癌组织中比正常样本中表达低，但是与TNM分期密切相关，且是独立预后因素。随后根据CHAC1表达和TNM分期构建Nomgram。
接下来，进行单基因-相关性分析（Neoantigens, MSI，TMB，免疫细胞浸润，免疫检查点和MMR基因），GSEA分析，过表达验证和临床样本验证。
结果
1.CHAC1表达及临床相关性
Fig.1
Fig.S1
2.单基因模型构建
Fig.2
3.单基因周边
单基因可适当拓展，加入Neoantigens, MSI，TMB，免疫细胞浸润，免疫检查点和MMR基因等内容。
Fig.3
Fig.4
Fig.5
4.CHAC1细胞表型验证
感悟
筛选出目标基因后，适当拓展内容弄个，增加人流量。
Fig.6
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