Label Free非标记定量技术

非标记定量蛋白质组学 (Label Free)近年来成为重要的质谱定量方法，按照其原理进行分类，可以分为两类。Spectrum counts类的非标记定量方法，发展比较早，也形成了多种算法进行定量，但是主要的原理都是根据MS2的鉴定结果作为定量的基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量方法的原理是以MS1为基础，计算每个肽段信号在LCMS质谱上的积分，目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件，根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析的方法。

蛋白质非标记定量技术（Label Free）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label Free技术优势就在于蛋白质不需要进行标记，所需样品总量少，耗费低。

相比较iTRAQ/TMT等标记方法，Label Free非标记方法具有特定的技术优势：

a.检测起始样本量少； 

b.前处理少，更多保留样本最原始信息；

c.对于低丰度多肽的覆盖程度更高；

d.不受标记试剂盒限制，可进行大批量的样本检测。

标记定量与非标记定量技术的比较

百泰派克生物提供基于质谱的蛋白质定量服务，包括iTRAQ/TMT, Label-Free, SILAC, MRM/PRM及SWATH定量蛋白组学服务，欢迎垂询！