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kill命令批量终止后台进程

kill命令批量终止后台进程

作者: Y大宽 | 来源:发表于2019-05-20 13:38 被阅读6次

因为数据量太大,大概一次执行太多了,总共727个样本,.sra文件每个平均大概5个G。一次批量转成200个样本到fq格式,结果内存爆了。所以需要终止进程。

ps -ef |grep 'fastq-dump'|grep -v grep|awk '{print$2}'|xargs kill -9

ps -ef 用于获取当前系统所有进程,如上图所示。
  grep fastq-dump 过滤出与“fastq-dump”字符相关的数据(以行为单位)。
  grep -v grep 的作用是除去本次操作所造成的影响,-v 表示反向选择。
  awk '{print 2}' 表示筛选出我们所关注的进程号,2 表示每行第二个变量,在这个例子中就是进程号。所以如果你使用ps工具不一样,或者ps带的参数不一样,那需要关注的就可能不是2,可能是1 。
  xargs kill -9 中的 xargs 命令表示用前面命令的输出结果(也就是一系列的进程号)作为 kill -9 命令的参数,-9 表示强制终止,不是必须的。


也可以用下面这个命令

killall -9 fastq-dump

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