基于gene expression signature的亚型预测的主要目标：捕获每个样品中这些基因的表达模式是否存在，而不是概括signature gene expressions复杂组合模式。
因此就有大神针对这个需求，开发了NTP算法。
NTP：NearestTemplatePrediction，最近模板预测。这个翻译比较生硬，置于专业翻译是什么，感兴趣的小伙伴请自行查找。
NTP使用预先定义的标记基因，对目标样本进行亚型预测，并返回每个样本预测的显著性p值。
优点：仅使用marker genes和表达矩阵就可对样本亚型进行预测，并给出预测的置信度。
PMID: 21124904
signature：与其他cluster相比，每个cluster中过表达基因的串联。并删除在多个cluster中明显过度表达的基因。
目前推荐实现的方式是GenePattern的NTP模块，下面来阅读下具体的说明书：
输入文件：
.gct 格式的基因表达矩阵tab分割符的txt格式文件
参考链接：
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本文标题：【NTP】亚型预测神器
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/nitndltx.html
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