prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt
sra数据会下载到家目录下的ncbi/public/sra中,perfetch 默认aspera下载(如果存在于环境变量,否则使用https下载)。
此外,也可设置aspera,Ex:prefetch -t ascp -a "/opt/aspera/bin/ascp|/opt/aspera/bin/asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file file.txt; file.txt 格式为每一行一个SRR#,可以使用下载界面的RunInfo table下载的文件。
RNAseq的数据下载的格式为sra。
接下来要在网页要看测序数据是单端还是双端数据。
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