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2019-03-17 NCBI数据库的bug

2019-03-17 NCBI数据库的bug

作者: keaidelele | 来源:发表于2019-03-17 11:27 被阅读0次

    archea物种信息里面,gcf与taxid对应不上
    在ncbi数据库 按照gcf搜索,得到了新的taxid号

    GCF_003841465.1 1679083
    GCF_002813655.1 59277
    

    +++++++++++++++++++++++++++++++++
    2019年4月22日更新,NCBI数据库的BUG
    以下是本人手动纠正gff3中的错误,从gff中查找taxid,总有很多错误,233

    GCF_900538225.1 2497989
    GCF_001022525.2 2494701
    GCF_003024815.1 2094151
    GCF_000965885.1 2494701
    GCF_003024805.1 2094150
    GCF_001688845.2 1796646
    GCF_001011955.1 1812935
    GCF_000958265.1 2494701
    GCF_000958085.1 2071710
    GCF_000958285.1 2494701
    GCF_003594935.1 2494702
    GCF_003261295.1 2527775
    GCF_003289495.1 2527775
    GCF_003024845.1 1796646
    GCF_003024855.1 1796646
    GCF_003289545.1 2527775
    GCF_001631105.1 2494701
    GCF_001886715.1 2213200
    GCF_003261275.1 2527775
    GCF_001984825.1 2494701
    GCF_000011365.1 224911
    GCF_003594915.1 2497875
    GCF_001022675.1 2494701
    GCF_900538215.1 2497989
    GCF_003024925.1 2094151
    

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