组间差异柱状图
柱状图又称条形图,是一种以长方形的长度为变量的统计图表,用来比较两个或多个的含量或者丰度(不同时间或者不同条件),只有一个变量,通常利用于较小的数据集分析。在生信数据分析中,比较组间差异是十分重要的分析内容,而显著性检验作为判断两个乃至多个数据集之间是否存在差异的方法被广泛应用。TUTU网站提供了t_test、wilcox_test、sign_test、dunn_test等四种检验方法,并将检验结果以p值或*号的形式展现在柱状图中,可以更清晰的展示数据集中组与组之间、组内存在的差异情况。以下是组间差异柱状图绘图的使用说明。
imageTUTU网站工具使用
小编给大家介绍一个在线作图工具,组间差异柱状图方法如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(已经为大家填好了),输入验证码后即可登录;
③登录后在全部工具那一栏找到组间差异柱状图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作~
上传文件
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据);
b)表格需要带表头和列名,每一列为数据指标名,每行为每列对应数据指标名的对应数据;
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。
参数设置
1. 检验方法选择:t_test、wilcox_test、sign_test、dunn_test四种检验方法
1)t_test:t检验,主要用于样本含量较小,总体标准差σ未知的正态分布, t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均数的差异是否显著。
2)wilcox_test:wilcox秩和检验,非参数检验,在不需要假设两组样本数据为正态分布的情况下,测试二者数据分布是否存在显著差异。
3)sign_test:符号检验,通过两个相关样本的每对数据之差的符号进行检验,从而比较两个样本的差异性。
4)dunn_test:邓恩检验,平均秩和多重比较的事后两两检验,用于多重非参数比较。
2.显著性差异选择:显示p值、、p+或不显示
3.自定义纵坐标:按需自行设置
下载文件
点击“运行”开始作图,点击“下载”保存图片。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。
作图后处理
TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。
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