看2020年新发表的文章,把基因渐渗工具分为几类。
基于种间群体基因频率变异分析 (Fst, LD, STRUCTURE, AFS, TreeMix)和基于种间DNA序列差异分析(ABBA-BABA, IM, IIM, ABC) 方法,
常用的分析基因渗入的工具有:
MixMapper,TreeMix 和 TARGet ,shapiet(人类),Dsuite
Dsuite github教程
Dsuite 中文教程
使用plink将vcf转换成treeMix可以使用的格式
看2020年新发表的文章,把基因渐渗工具分为几类。
基于种间群体基因频率变异分析 (Fst, LD, STRUCTURE, AFS, TreeMix)和基于种间DNA序列差异分析(ABBA-BABA, IM, IIM, ABC) 方法,
常用的分析基因渗入的工具有:
MixMapper,TreeMix 和 TARGet ,shapiet(人类),Dsuite
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使用plink将vcf转换成treeMix可以使用的格式
本文标题:TOOL:Dsuite--基因渗入分析工具
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