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Keras 开发一个复杂深度学习模型实战

Keras 开发一个复杂深度学习模型实战

作者: hugoren | 来源:发表于2018-03-01 15:02 被阅读0次

    Keras 是提供一些高可用的 Python API ,能帮助你快速的构建和训练自己的深度学习模型,它的后端是 TensorFlow 或者 Theano 。本文假设你已经熟悉了 TensorFlow 和卷积神经网络,如果,你还没有熟悉,那么可以先看看这个10分钟入门 TensorFlow 教程卷积神经网络教程,然后再回来阅读这个文章。

    在这个教程中,我们将学习以下几个方面:

    1. 为什么选择 Keras?为什么 Keras 被认为是深度学习的未来?
    2. 在Ubuntu上面一步一步安装Keras。
    3. Keras TensorFlow教程:Keras基础知识。
    4. 了解 Keras 序列模型
      4.1 实际例子讲解线性回归问题
    5. 使用 Keras 保存和回复预训练的模型
    6. Keras API
      6.1 使用Keras API开发VGG卷积神经网络
      6.2 使用Keras API构建并运行SqueezeNet卷积神经网络

    1. 为什么选择Keras?

    Keras 是 Google 的一位工程师 François Chollet 开发的一个框架,可以帮助你在 Theano 上面进行快速原型开发。后来,这被扩展为 TensorFlow 也可以作为后端。并且最近,TensorFlow决定将其作为 contrib 文件中的一部分进行提供。

    Keras 被认为是构建神经网络的未来,以下是一些它流行的原因:

    1. 轻量级和快速开发:Keras 的目的是在消除样板代码。几行 Keras 代码就能比原生的 TensorFlow 代码实现更多的功能。你也可以很轻松的实现 CNN 和 RNN,并且让它们运行在 CPU 或者 GPU 上面。

    2. 框架的“赢者”:Keras 是一个API,运行在别的深度学习框架上面。这个框架可以是 TensorFlow 或者 Theano。Microsoft 也计划让 CNTK 作为 Keras 的一个后端。目前,神经网络框架世界是非常分散的,并且发展非常快。具体,你可以看看 Karpathy 的这个推文:

    [图片上传失败...(image-aaffcd-1519887697469)]

    想象一下,我们每年都要去学习一个新的框架,这是多么的痛苦。到目前为止,TensorFlow 似乎成为了一种潮流,并且越来越多的框架开始为 Keras 提供支持,它可能会成为一种标准。

    目前,Keras 是成长最快的一种深度学习框架。因为可以使用不同的深度学习框架作为后端,这也使得它成为了流行的一个很大的原因。你可以设想这样一个场景,如果你阅读到了一篇很有趣的论文,并且你想在你自己的数据集上面测试这个模型。让我们再次假设,你对TensorFlow 非常熟悉,但是对Theano了解的非常少。那么,你必须使用TensorFlow 对这个论文进行复现,但是这个周期是非常长的。但是,如果现在代码是采用Keras写的,那么你只要将后端修改为TensorFlow就可以使用代码了。这将是对社区发展的一个巨大的推动作用。

    2. 怎么安装Keras,并且把TensorFlow作为后端

    a) 依赖安装

    安装 h5py,用于模型的保存和载入:

    pip install h5py
    
    

    还有一些依赖包也要安装。

    pip install numpy scipy
    pip install pillow
    
    

    如果你还没有安装TensorFlow,那么你可以按照这个教程先去安装TensorFlow。一旦,你安装完成了 TensorFlow,你只需要使用 pip 很容易的安装 Keras。

    sudo pip install keras
    
    

    使用以下命令来查看 Keras 版本。

    >>> import keras
    Using TensorFlow backend.
    >>> keras.__version__
    '2.0.4'
    
    

    一旦,Keras 被安装完成,你需要去修改后端文件,也就是去确定,你需要 TensorFlow 作为后端,还是 Theano 作为后端,修改的配置文件位于 ~/.keras/keras.json 。具体配置如下:

    {
        "floatx": "float32",
        "epsilon": 1e-07,
        "backend": "tensorflow",
        "image_data_format": "channels_last"
    }
    
    

    请注意,参数 image_data_formatchannels_last ,也就是说这个后端是 TensorFlow。因为,在TensorFlow中图像的存储方式是[height, width, channels],但是在Theano中是完全不同的,也就是 [channels, height, width]。因此,如果你没有正确的设置这个参数,那么你模型的中间结果将是非常奇怪的。对于Theano来说,这个参数就是channels_first

    那么,至此你已经准备好了,使用Keras来构建模型,并且把TensorFlow作为后端。

    3. Keras基础知识

    在Keras中主要的数据结构是 model ,该结构定义了一个完整的图。你可以向已经存在的图中加入任何的网络结构。

    import keras
    
    

    Keras 有两种不同的建模方式:

    1. Sequential models:这种方法用于实现一些简单的模型。你只需要向一些存在的模型中添加层就行了。

    2. Functional API:Keras的API是非常强大的,你可以利用这些API来构造更加复杂的模型,比如多输出模型,有向无环图等等。

    在本文的下一节中,我们将学习Keras的Sequential models 和 Functional API的理论和实例。

    4. Keras Sequential models

    在这一部分中,我将来介绍Keras Sequential models的理论。我将快速的解释它是如何工作的,还会利用具体代码来解释。之后,我们将解决一个简单的线性回归问题,你可以在阅读的同时运行代码,来加深印象。

    以下代码是如何开始导入和构建序列模型。

    from keras.models import Sequential
    models = Sequential()
    
    

    接下来我们可以向模型中添加 Dense(full connected layer),Activation,Conv2D,MaxPooling2D函数。

    from keras.layers import Dense, Activation, Conv2D, MaxPooling2D, Flatten, Dropout
    model.add(Conv2D(64, (3,3), activation='relu', input_shape = (100,100,32)))
    # This ads a Convolutional layer with 64 filters of size 3 * 3 to the graph
    
    

    以下是如何将一些最流行的图层添加到网络中。我已经在卷积神经网络教程中写了很多关于图层的描述。

    1. 卷积层

    这里我们使用一个卷积层,64个卷积核,维度是3*3的,之后采用 relu 激活函数进行激活,输入数据的维度是 100*100*32。注意,如果是第一个卷积层,那么必须加上输入数据的维度,后面几个这个参数可以省略。

    model.add(Conv2D(64, (3,3), activation='relu', input_shape = (100,100,32)))
    
    

    2. MaxPooling 层

    指定图层的类型,并且指定赤的大小,然后自动完成赤化操作,酷毙了!

    model.add(MaxPooling2D(pool_size=(2,2)))
    
    

    3. 全连接层

    这个层在 Keras 中称为被称之为 Dense 层,我们只需要设置输出层的维度,然后Keras就会帮助我们自动完成了。

    model.add(Dense(256, activation='relu'))
    
    

    4. Dropout

    model.add(Dropout(0.5))
    
    

    5. 扁平层

    model.add(Flatten())
    
    

    数据输入

    网络的第一层需要读入训练数据。因此我们需要去制定输入数据的维度。因此,input_shape参数被用于制定输入数据的维度大小。

    model.add(Conv2D(32, (3,3), activation='relu', input_shape=(224, 224, 3)))
    
    

    在这个例子中,数据输入的第一层是一个卷积层,输入数据的大小是 2242243** 。

    以上操作就帮助你利用序列模型构建了一个模型。接下来,让我们学习最重要的一个部分。一旦你指定了一个网络架构,你还需要指定优化器和损失函数。我们在Keras中使用compile函数来达到这个功能。比如,在下面的代码中,我们使用 rmsprop 来作为优化器,binary_crossentropy 来作为损失函数值。

    model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop')
    
    

    如果你想要使用随机梯度下降,那么你需要选择合适的初始值和超参数:

    from keras.optimizers import SGD
    sgd = SGD(lr=0.01, decay=1e-6, momentum=0.9, nesterov=True)
    model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer=sgd)
    
    

    现在,我们已经构建完了模型。接下来,让我们向模型中输入数据,在Keras中是通过 fit 函数来实现的。你也可以在该函数中指定 batch_sizeepochs 来训练。

    model.fit(x_train, y_train, batch_size = 32, epochs = 10, validation_data(x_val, y_val))
    
    

    最后,我们使用 evaluate 函数来测试模型的性能。

    score = model.evaluate(x_test, y_test, batch_size = 32)
    
    

    这些就是使用序列模型在Keras中构建神经网络的具体操作步骤。现在,我们来构建一个简单的线性回归模型。

    4.1 实际例子讲解线性回归问题

    问题陈述

    在线性回归问题中,你可以得到很多的数据点,然后你需要使用一条直线去拟合这些离散点。在这个例子中,我们创建了100个离散点,然后用一条直线去拟合它们。

    a) 创建训练数据

    TrainX 的数据范围是 -1 到 1,TrainY 与 TrainX 的关系是3倍,并且我们加入了一些噪声点。

    import keras
    from keras.models import Sequential
    from keras.layers import Dense
    import numpy as np
    
    trX = np.linspace(-1, 1, 101)
    trY = 3 * trX + np.random.randn(*trX.shape) * 0.33
    
    

    b) 构建模型

    首先我们需要构建一个序列模型。我们需要的只是一个简单的链接,因此我们只需要使用一个 Dense 层就够了,然后用线性函数进行激活。

    model = Sequential()
    model.add(Dense(input_dim=1, output_dim=1, init='uniform', activation='linear'))
    
    

    下面的代码将设置输入数据 x,权重 w 和偏置项 b。然我们来看看具体的初始化工作。如下:

    weights = model.layers[0].get_weights()
    w_init = weights[0][0][0]
    b_init = weights[1][0]
    print('Linear regression model is initialized with weights w: %.2f, b: %.2f' % (w_init, b_init)) 
    ## Linear regression model is initialized with weight w: -0.03, b: 0.00
    
    

    现在,我们可以l利用自己构造的数据 trXtrY 来训练这个线性模型,其中 trYtrX 的3倍。因此,权重 w 的值应该是 3。

    我们使用简单的梯度下降来作为优化器,均方误差(MSE)作为损失值。如下:

    model.compile(optimizer='sgd', loss='mse')
    
    

    最后,我们使用 fit 函数来输入数据。

    model.fit(trX, trY, nb_epoch=200, verbose=1)
    
    

    在经过训练之后,我们再次打印权重:

    weights = model.layers[0].get_weights()
    w_final = weights[0][0][0]
    b_final = weights[1][0]
    print('Linear regression model is trained to have weight w: %.2f, b: %.2f' % (w_final, b_final))
    
    ##Linear regression model is trained to have weight w: 2.94, b: 0.08
    
    

    正如你所看到的,在运行 200 轮之后,现在权重非常接近于 3。你可以将运行的轮数修改为区间 [100, 300] 之间,然后观察输出结构有什么变化。现在,你已经学会了利用很少的代码来构建一个线性回归模型,如果要构建一个相同的模型,在 TensorFlow 中需要用到更多的代码。

    5. 使用 Keras 保存和回复预训练的模型

    HDF5 二进制格式

    一旦你利用Keras完成了训练,你可以将你的网络保存在HDF5里面。当然,你需要先安装 h5py。HDF5 格式非常适合存储大量的数字收,并从 numpy 处理这些数据。比如,我们可以轻松的将存储在磁盘上的多TB数据集进行切片,就好像他们是真正的 numpy 数组一样。你还可以将多个数据集存储在单个文件中,遍历他们或者查看 .shape.dtype 属性。

    如果你需要信心,那么告诉你,NASA也在使用 HDF5 进行数据存储。h5py 是python对HDF5 C API 的封装。几乎你可以用C在HDF5上面进行的任何操作都可以用python在h5py上面操作。

    保存权重

    如果你要保存训练好的权重,那么你可以直接使用 save_weights 函数。

    model.save_weights("my_model.h5")
    
    

    载入预训练权重

    如果你想要载入以前训练好的模型,那么你可以使用 load_weights 函数。

    model.load_weights('my_model_weights.h5')
    
    

    6. Keras API

    如果对于简单的模型和问题,那么序列模型是非常好的方式。但是如果你要构建一个现实世界中复杂的网络,那么你就需要知道一些功能性的API,在很多流行的神经网络中,我们都有一个最小的网络结构,完整的模型是根据这些最小的模型进行叠加完成的。这些基础的API可以让你一层一层的构建模型。因此,你只需要很少的代码就可以来构建一个完整的复杂神经网络。

    让我们来看看它是如何工作的。首先,你需要导入一些包。

    from keras.models import Model
    
    

    现在,你需要去指定输入数据,而不是在顺序模型中,在最后的 fit 函数中输入数据。这是序列模型和这些功能性的API之间最显著的区别之一。我们使用 input() 函数来申明一个 12828 的张量。

    from keras.layers import Input
    ## First, define the vision modules
    
    digit_input = Input(shape=(1, 28, 28))
    
    

    现在,让我们来利用API设计一个卷积层,我们需要指定要在在哪个层使用卷积网络,具体代码这样操作:

    x = Conv2D(64, (3, 3))(digit_input)
    x = Conv2D(64, (3, 3))(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2))(x)
    out = Flatten()(x)
    
    

    最后,我们对于指定的输入和输出数据来构建一个模型。

    vision_model = Model(digit_input, out)
    
    

    当然,我们还需要指定损失函数,优化器等等。但这些和我们在序列模型中的操作一样,你可以使用 fit 函数和 compile 函数来进行操作。

    接下来,让我们来构建一个vgg-16模型,这是一个很大很“老”的模型,但是由于它的简洁性,它是一个很好的学习模型。

    6.1 使用Keras API开发VGG卷积神经网络

    VGG:

    VGG卷积神经网络是牛津大学在2014年提出来的模型。当这个模型被提出时,由于它的简洁性和实用性,马上成为了当时最流行的卷积神经网络模型。它在图像分类和目标检测任务中都表现出非常好的结果。在2014年的ILSVRC比赛中,VGG 在Top-5中取得了92.3%的正确率。 该模型有一些变种,其中最受欢迎的当然是 vgg-16,这是一个拥有16层的模型。你可以看到它需要维度是 2242243 的输入数据。

    [图片上传失败...(image-c813e6-1519887697469)]

    让我们来写一个独立的函数来完整实现这个模型。

    img_input = Input(shape=input_shape)
    # Block 1
    x = Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block1_conv1')(img_input)
    x = Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block1_conv2')(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block1_pool')(x)
    
    # Block 2
    x = Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block2_conv1')(x)
    x = Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block2_conv2')(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block2_pool')(x)
    
    # Block 3
    x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv1')(x)
    x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv2')(x)
    x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv3')(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block3_pool')(x)
    
    # Block 4
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv1')(x)
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv2')(x)
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv3')(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block4_pool')(x)
    
    # Block 5
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv1')(x)
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv2')(x)
    x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv3')(x)
    x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block5_pool')(x)
    
    x = Flatten(name='flatten')(x)
    x = Dense(4096, activation='relu', name='fc1')(x)
    x = Dense(4096, activation='relu', name='fc2')(x)
    x = Dense(classes, activation='softmax', name='predictions')(x)
    
    

    我们可以将这个完整的模型,命名为 vgg16.py。

    在这个例子中,我们来运行 imageNet 数据集中的某一些数据来进行测试。具体代码如下:

    model = applications.VGG16(weights='imagenet')
    img = image.load_img('cat.jpeg', target_size=(224, 224))
    x = image.img_to_array(img)
    x = np.expand_dims(x, axis=0)
    x = preprocess_input(x)
    preds = model.predict(x)
    for results in decode_predictions(preds):
        for result in results:
            print('Probability %0.2f%% => [%s]' % (100*result[2], result[1]))
    
    

    [图片上传失败...(image-3b1cc6-1519887697469)]

    正如你在图中看到的,模型会对图片中的物体进行一个识别预测。

    我们通过API构建了一个VGG模型,但是由于VGG是一个很简单的模型,所以并没有完全将API的能力开发出来。接下来,我们通过构建一个 SqueezeNet模型,来展示API的真正能力。

    6.2 使用Keras API构建并运行SqueezeNet卷积神经网络

    SequeezeNet 是一个非常了不起的网络架构,它的显著点不在于对正确性有多少的提高,而是减少了计算量。当SequeezeNet的正确性和AlexNet接近时,但是ImageNet上面的预训练模型的存储量小于5 MB,这对于在现实世界中使用CNN是非常有利的。SqueezeNet模型引入了一个 Fire模型,它由交替的 Squeeze 和 Expand 模块组成。

    [图片上传失败...(image-c1b2bf-1519887697469)]

    现在,我们对 fire 模型进行多次复制,从而来构建完整的网络模型,具体如下:

    [图片上传失败...(image-6208be-1519887697469)]

    为了去构建这个网络,我们将利用API的功能首先来构建一个单独的 fire 模块。

    # Squeeze part of fire module with 1 * 1 convolutions, followed by Relu
    x = Convolution2D(squeeze, (1, 1), padding='valid', name='fire2/squeeze1x1')(x)
    x = Activation('relu', name='fire2/relu_squeeze1x1')(x)
    
    #Expand part has two portions, left uses 1 * 1 convolutions and is called expand1x1 
    left = Convolution2D(expand, (1, 1), padding='valid', name='fire2/expand1x1')(x)
    left = Activation('relu', name='fire2/relu_expand1x1')(left)
    
    #Right part uses 3 * 3 convolutions and is called expand3x3, both of these are follow#ed by Relu layer, Note that both receive x as input as designed. 
    right = Convolution2D(expand, (3, 3), padding='same', name='fire2/expand3x3')(x)
    right = Activation('relu', name='fire2/relu_expand3x3')(right)
    
    # Final output of Fire Module is concatenation of left and right. 
    x = concatenate([left, right], axis=3, name='fire2/concat')
    
    

    为了重用这些代码,我们可以将它们转换成一个函数:

    sq1x1 = "squeeze1x1"
    exp1x1 = "expand1x1"
    exp3x3 = "expand3x3"
    relu = "relu_"
    WEIGHTS_PATH = "https://github.com/rcmalli/keras-squeezenet/releases/download/v1.0/squeezenet_weights_tf_dim_ordering_tf_kernels.h5"
    
    

    模块化处理

    sq1x1 = "squeeze1x1"
    exp1x1 = "expand1x1"
    exp3x3 = "expand3x3"
    relu = "relu_"
    
    def fire_module(x, fire_id, squeeze=16, expand=64):
       s_id = 'fire' + str(fire_id) + '/'
       x = Convolution2D(squeeze, (1, 1), padding='valid', name=s_id + sq1x1)(x)
       x = Activation('relu', name=s_id + relu + sq1x1)(x)
    
       left = Convolution2D(expand, (1, 1), padding='valid', name=s_id + exp1x1)(x)
       left = Activation('relu', name=s_id + relu + exp1x1)(left)
    
       right = Convolution2D(expand, (3, 3), padding='same', name=s_id + exp3x3)(x)
       right = Activation('relu', name=s_id + relu + exp3x3)(right)
    
       x = concatenate([left, right], axis=3, name=s_id + 'concat')
    return x
    
    

    现在,我们可以利用我们构建好的单独的 ** fire** 模块,来构建完整的模型。

    x = Convolution2D(64, (3, 3), strides=(2, 2), padding='valid', name='conv1')(img_input)
    x = Activation('relu', name='relu_conv1')(x)
    x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool1')(x)
    
    x = fire_module(x, fire_id=2, squeeze=16, expand=64)
    x = fire_module(x, fire_id=3, squeeze=16, expand=64)
    x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool3')(x)
    
    x = fire_module(x, fire_id=4, squeeze=32, expand=128)
    x = fire_module(x, fire_id=5, squeeze=32, expand=128)
    x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool5')(x)
    
    x = fire_module(x, fire_id=6, squeeze=48, expand=192)
    x = fire_module(x, fire_id=7, squeeze=48, expand=192)
    x = fire_module(x, fire_id=8, squeeze=64, expand=256)
    x = fire_module(x, fire_id=9, squeeze=64, expand=256)
    x = Dropout(0.5, name='drop9')(x)
    
    x = Convolution2D(classes, (1, 1), padding='valid', name='conv10')(x)
    x = Activation('relu', name='relu_conv10')(x)
    x = GlobalAveragePooling2D()(x)
    out = Activation('softmax', name='loss')(x)
    
    model = Model(inputs, out, name='squeezenet')
    
    

    完整的网络模型我们放置在 squeezenet.py 文件里。我们应该先下载 imageNet 预训练模型,然后在我们自己的数据集上面进行训练和测试。下面的代码就是实现了这个功能:

    import numpy as np
    from keras_squeezenet import SqueezeNet
    from keras.applications.imagenet_utils import preprocess_input, decode_predictions
    from keras.preprocessing import image
    
    model = SqueezeNet()
    
    img = image.load_img('pexels-photo-280207.jpeg', target_size=(227, 227))
    x = image.img_to_array(img)
    x = np.expand_dims(x, axis=0)
    x = preprocess_input(x)
    
    preds = model.predict(x)
    all_results = decode_predictions(preds)
    for results in all_results:
      for result in results:
        print('Probability %0.2f%% => [%s]' % (100*result[2], result[1]))
    
    

    对于相同的一幅图预测,我们可以得到如下的预测概率。

    转自:
    https://www.jianshu.com/p/20585e3b6d02

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