昨天晚上8点多从实验室离开,要是在往常,我一定会坐下来写一篇帖子再走。但是昨天,或者说近期都没那么强烈。在比较累的...
上一期的教程【科研猫】生存分析的正确姿势(1)视频+R代码分享,给大家讲解了批量对TCGA中的基因进行生存分析的第...
文章流程 下载VarScan方法的TCGA的maf突变格式文件 计算突变基因,寻找至少在15个样本都存在突变的基因...
上一期的教程【科研猫】生存分析的正确姿势(1)视频+R代码分享 - 简书,给大家讲解了批量对TCGA中的基因进行生...
我们平时使用TCGA的使用,基本都是下载临床特征数据,生存数据,基因表达量,高级一点的还可以去下载体细胞突变,拷贝...
使用 XENA**的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图。 一基因词云 ...
一从TCGA下载突变信息 这里下载的是maf文件 二把样本根据是否突变分为野生型和突变型 可以看到包含了突变基因和...
几天在一个讨论群里看见有人 问是 否可以有偿做TCGA中 某个肿瘤的突变基因瀑布图吗,瀑布图之前听过,但是自己没有...
前期基础:[R]TCGAbiolinks包:数据准备--query、download、prepare - 简书 (...
4.将差异甲基化位点拿来做批量生存分析 logrank test批量生存分析 这里和TCGA系列里的内容是一样的,...
本文标题:批量查看TCGA中基因的突变对于生存的影响,一个两个都可以!
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/nspwbctx.html
网友评论