小编发现我们经常使用的TCGA数据库，大概在2022年4月初进行了更新。以前RNAseq数据使用的是Htseq-c...[作者空间]
前面小编给大家详细介绍过TCGA这个数据库，以及如何从这个数据库下载，合并表达谱数据。然后做差异表达分析，以及构建...[作者空间]
前言 近年来，随着免疫检查点抑制剂的兴起，大大改变了传统的肿瘤治疗策略，尽管 PD-L1 和 dMMR 的检测都获...[作者空间]
前言 在介绍完 TCGAbiolinks 的查询下载和数据分析功能之后，我们简单展示几个示例，来练练手，加深对这个...[作者空间]
我们知道TCGA数据库包括很多患者的二代测序的数据。关于二代测序。之前我们就介绍过，其实二代测序的数据是是一部分所...[作者空间]
参考： 批量下载SRR数据从NCBI-SRA和EBI-ENA数据库下载数据 最近下载了一些比较大数据，自己感觉下载...[作者空间]
部分一 第一步、数据下载阶段 第二步：GDCdownload()下载GDCquery()得到的结果 第三步、数据处...[作者空间]
癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类：肿瘤相关性抗原（tumor-associatied self-anti...[作者空间]
背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看，当然也有一些弊端，...[作者空间]
昨天晚上8点多从实验室离开，要是在往常，我一定会坐下来写一篇帖子再走。但是昨天，或者说近期都没那么强烈。在比较累的...[作者空间]
昨天的教程我很喜欢，以后再配上个基因启动子转录调控因子筛选的技能，就是神技中的神技。跟Nature一起学习TCGA...[作者空间]
这是果子学生信文献阅读群的第一个产品，起源可以看一下这篇帖子，科研工作者的力量来自持续不断的读文献！ 这一篇文献是...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! TCGA对于不同类型的数据，有着独特的处理流程，具体如下 1. DNA-Seq Ana...[作者空间]
前天是全网第一个单细胞转录组视频课程的收官阶段，第四单元我们复现了单细胞转录组数据的结论是如何使用TCGA等公共数...[作者空间]
