[ZCH_luxm@login NCBI]$ module load apps/sratoolkit/2.10.8
[ZCH_luxm@login NCBI]$ prefetch SRR7072135
This sra toolkit installation has not been configured.
Before continuing, please run: vdb-config --interactive
For more information, see https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/sra-cloud/
如果直接使用module load加载软件时显示错误，可以用
[ZCH_luxm@login NCBI]$ /public/software/apps/sratoolkit/2.10.8/bin/prefetch SRR7072135 #下载单个SRA数据
prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt #批量下载
fastq-dump SRR7072135 #将sra转换成fastq
fastq-dump --fasta 50 SRR7072135 #sra转换成fasta，50为每行50个碱基
fastq-dump --split-files SRR1553610 #将双端测序文件分开
fastq-dump --split-3 filename其中--split-3参数代表着如果是单端测序就生成一个 、.fastq文件，如果是双端测序就生成_1.fastq 和*_2.fastq 文件。
进入到sra文件中我们可以用下述代码进行批量的格式转化：
for i in *sra
do
echo $i
fastq-dump --split-3 $i
done
参考：
https://www.jianshu.com/p/e74bb9b2c5a9
https://blog.csdn.net/xubo245/article/details/50510026
https://www.jianshu.com/p/68353a2bdd31
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