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2022-09-26 TIMER数据库

2022-09-26 TIMER数据库

作者: 千容安 | 来源:发表于2022-09-26 21:05 被阅读0次

    TIMER:计时器2.0 (comp-genomics.org)
    这篇推文是使用方法:https://mp.weixin.qq.com/s/1np1ItJVV53tf0nY-7umWQ

    要用tpm标准化的数据。一开始用RNA-seq的数据,会报错,就从GDC下载了肿瘤的数据。后来发现上传RNA-seq时选择小鼠就能加载成功了。
    GDC的数据得到tsv(其中一个样本)如图:

    取箭头这列,把样本的这列放在一起作为输入文件。

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