对于fragment counts建模可改善单细胞 ATAC-seq 分析（而非read counts/binary counts）：
https://www.nature.com/articles/s41592-023-02112-6
https://www.nature.com/articles/s41592-023-02112-6
主要内容 介绍了单细胞表观层面研究的意义 scATAC-seq实验、建库、分析的流程 单细胞表观层面研究的意义 生...
单细胞分析的主要问题存在较明显的批次效应，影响聚类效果，深度学习方法，逐渐可以应用到单细胞分析领域。单细胞RNA测...
单细胞 RNA-seq 数据 - 计数矩阵的原始数据 根据所使用的文库制备方法，RNA序列(也称为读序列或标签)将...
问题 一、有的文章只提供TPM的单细胞表达矩阵，可以用seurat分析吗？ 二、分析流程和用count矩阵有什么不...
单细胞转录组测序（scRNA-seq）能够解释细胞的转录状态，而单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)能够...
之前都是拿到单细胞counts矩阵进行后续的分析，这次主要基于10X的cellranger软件学习单细胞原始的测序...
计数归一化和主成分分析 在获得我们的高质量单细胞后，单细胞 RNA-seq (scRNA-seq) 分析工作流程的...
hi，大家好，好久不见，这次跟大家分享一个单细胞降维聚类的新的分析方法scanpy，目前大部多数文章用的单细胞分析...
今天我们来分享另外一个10X单细胞空间联合分析的方法----DSTG（Deconvoluting Spatial ...
Introduction 除了利用ballgown流程，目前比较流行的方法还是通过序列比对和计数获得的计数矩阵，然...
本文标题：单细胞笔记22-分享两篇深度分析scATAC-seq计数矩阵方法
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/oeiyodtx.html
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