【粉丝问题】挑选GO结果绘图，没有报错，也没有出图？

前面小编给大家介绍过

☞ 如何挑选感兴趣的GO条目进行展示

☞ R四种风格展示挑选的GO富集结果

☞ 如何挑选感兴趣的KEGG通路进行展示

☞ 【R】气泡图和柱形图展示挑选的KEGG通路

最近有个粉丝反馈，按照视频中的方法挑选出感兴趣的GO条目之后，运行R代码绘图，遇到了一个很诡异的问题。读取文件没有报错（error），虽然有一个warning（了解小编的人都知道，小编一向是忽略warning的，因为warning不会终止程序运行），

运行到后面画图的时候就有问题了。粉丝认真检查文件确实没有问题。小编拿到文件后，看到确实是一个csv文件，

也能用Excel打开，虽然跳出一个对话框。如果你直接叉掉了，可能很难发现问题所在了。这个警告说文件格式和后缀不匹配。

文件打开之后，可以看到还有颜色标注。csv文件虽然能用Excel打开，但本质上是一个纯文本文件，里面是无法设置格式的。即使你在Excel里面设置了，保存成csv文件的时候这部分信息也会丢失。

到这里，基本能断定问题出在文件格式上了。这位粉丝的GO_all_enrich_selected.csv文件，其实是一个披着csv外衣的xlsx文件。可能这位粉丝编辑完Excel文件后，为了保证跟视频里面的后缀一样，直接改了文件后缀名。

这里给出两个解决方法。

1. 打开这个假的GO_all_enrich_selected.csv文件，另存为真正的csv文件。具体可以参考
   ☞ 如何挑选感兴趣的GO条目进行展示

2.用R来读取xlsx文件

#安装readxl
BiocManager::install("readxl")
library(readxl)
#读取excel文件
GO_result=read_excel("GO_all_enrich_selected.csv")
GO_result

可以看到数据已经成功的读到GO_result中了

更多GO和KEGG富集分析相关的干货，可以参考GO和KEGG富集分析及可视化

接着再使用☞ R四种风格展示挑选的GO富集结果 画图就没有任何问题了。