https://github.com/pachterlab/ffq
github主页 https://github.com/pachterlab/ffq[https://github...
基本简介 原始数据(Raw data)指测序下机后未经处理的全部原始数据文件,SRA是NCBI中收录原始数据的主要...
1. 原始数据的解释及相关概念 原始数据的概念: A.测序仪完成测序后生产的测序文件,经过单样品拆分后,获得的单样...
我是使用conda安装的这个软件,首先激活虚拟环境 下载 默认是保存在 ncbi 文件夹下 这样是sra格式的数...
激活环境 运行 ascp如果安装好也可以用
人生苦短,我用Python 首先导入os模块,设置默认路径 读取数据,并查看数据 根据读取的原始数据进行分析,可将...
背景 上次提到根据SRA登录号从NCBI下载原始数据,是利用shell脚本下载测序数据,但是经常能碰到一些数据没有...
fastq-dump是常用用来下载NCBI原始测序SRA数据的工具,但是它的参数也是比较杂乱,我根据查到的数据说下...
2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...
有些时候,我们需要从genebank中下载别人原始的测序数据来学习。 最开始的时候,我只是从NCBI上面之间点击下...
本文标题:python模块查看ncbi原始测序数据的样本相关信息
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