生物信息入门-1 硬件的准备

作者: 黄桂安 | 来源:发表于2019-07-17 20:47 被阅读160次

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    对于生物学研究而言,目前测序技术的应用已非常广泛,是解析作用机制的有效利器。

    对于初入生物信息学的童鞋们而言,刚开始可能无从下手,本系列根据个人之前学习生物信息学的经历,总结出一个思维导图和攻略,希望能够给初学生信的童鞋一个简单的指引。

    #思维导图如下:

    生信学习思维导图

    今天我们先进行第一课,生信有什么硬件要求

    #一台电脑:

    对于电脑而言,包含几大硬件:CPU,主板,内存,硬盘,显卡,显示器等;

    生信对于硬件的要求主要在于CPU,内存和存储性能。简单说CPU核心数越多越好,内存越大越好,硬盘为存储设备,目前SSD有很大的数据读写速度上的优势,但成本较高,因此SSD和传统机械硬盘均配备,SSD用于系统盘,机械硬盘用于存储测序的数据。当然CPU和内存能否发挥最大性能也要看主板。

    CPU CPU Memory 硬盘

    对于经费比较宽裕的实验室,配备有服务器,性能强劲,远远高于个人电脑。

    #本文主要介绍个人电脑:推荐配置

    CPU:i5,i7

    内存:>8G

    固态硬盘(SSD):提升系统运行速度,其读取速度远快于普通硬盘,目前是电脑配置的主流配置,可将系统安装在SSD上。

    硬盘:>2T

    # 操作系统选择:

    那么有了电脑后,该选择什么系统?如思维导图,推荐安装linux(ubuntu)系统,当然如果您money充裕,来个苹果电脑也是杠杠的。windows系统一般不推荐。

    Linux系统有很多版本,本人推荐使用ubuntu的,官网https://ubuntu.com/。ubuntu系统界面如下图,Ubuntu 19.04

    ubuntu系统界面

    简书网站有很多安装ubuntu系统的攻略,以及在windows系统下安装双系统的方法,大家可自行搜索。

    苹果的macOS系统更加方便。

    有了硬件,后面就要开始对生物信息进行简单的认识了,且听下回分解!

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