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2022-09-29 summarise group_by

2022-09-29 summarise group_by

作者: 学习生信的小兔子 | 来源:发表于2022-09-29 08:43 被阅读0次
#先看看基因是否有重复
table(exprSet$symbol)
#可看出基因有重复

#########接下来根据最大值去重#########
exp=exprSet %>% 
  mutate(rowmean=rowMeans(.[,-1])) %>% 
  arrange(rowmean) %>% 
  distinct(symbol,.keep_all = TRUE) %>% 
  arrange(-rowmean)

#########探针平均值#########
exp1=exprSet %>% 
  group_by(symbol) %>% 
  summarise_all(mean)


### 3.重复的探针都不要(比较极端)
data4 <- exprSet%>%  
  group_by(symbol) %>% 
  mutate(n=n()) %>% 
  filter(n==1) %>% 
  dplyr::select(-n)



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