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2022-09-29 summarise group_by

2022-09-29 summarise group_by

作者: 学习生信的小兔子 | 来源:发表于2022-09-29 08:43 被阅读0次
    #先看看基因是否有重复
    table(exprSet$symbol)
    #可看出基因有重复
    
    #########接下来根据最大值去重#########
    exp=exprSet %>% 
      mutate(rowmean=rowMeans(.[,-1])) %>% 
      arrange(rowmean) %>% 
      distinct(symbol,.keep_all = TRUE) %>% 
      arrange(-rowmean)
    
    #########探针平均值#########
    exp1=exprSet %>% 
      group_by(symbol) %>% 
      summarise_all(mean)
    
    
    ### 3.重复的探针都不要(比较极端)
    data4 <- exprSet%>%  
      group_by(symbol) %>% 
      mutate(n=n()) %>% 
      filter(n==1) %>% 
      dplyr::select(-n)
    
    
    
    

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