背景知识回顾：

1.R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。
2.表格在R语言中改名叫数据框^_
3.?+命令或者函数，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
4.数据类型：
（1）向量（vector）
（2）矩阵（Matrix）
（3）数组（Array）
（4）数据框（Data frame）
（5）List

以下开始正文部分：

part1：向量

1.标量和向量的区分:

元素指的是数字或者字符串等，根据它可以区分两个词：
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
例如：
x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
提示：后一次的赋值能覆盖前一次，避免用常见名称如pi赋值。

2.从向量中提取元素

（1）根据元素位置，例如：
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2到4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
（2）根据值的大小
x[x==10]#等于10的元素 ==意思是等于
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

Part2：数据框

按照教程例子，先在工作目录下添加文档doudou.txt，里面内容如下：
X1,X2
A,1
B,
C,
D,3
E,
(#NA空值可留空，不用输入)
用以下命令即可读取数据框：x<-read.csv('doudou.txt')#区分大小写

（1）读取本地数据

read.table(file = "doudou.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件，分隔符为Tab，有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a

以上命令等同与a<-read.csv('doudou.txt')

（2）设置行名和列名

x<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量x是一个数据框
colnames(x) #查看列名
rownames(x) #查看行名
colnames(x)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
x<-read.csv(file = "doudou.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

（3）数据框的导出

write.table(x,file = "new.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） #在工作路径下会看到new.txt的新文件

（4）变量的保存与重新加载

保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量，frame1修改成自己要保存的变量名称
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令，frame1注意修改名称

（5）提取元素

（#以下命令括号外x代表向量名称，[ ]内代表行列数）
x[x,y]#第x行第y列
x[x,]#第x行
x[,y]#第y列（横着写，这是不够懒也不够优秀却能存在的写法）
x[y] #第y列（竖着写，这是懒惰又优秀的写法）
x[a:b]#第a列到第b列
x[c(a,b)]#第a列和第b列
x$列名 #支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

（6）【选修部分】直接使用数据框中的变量

提取某两列作散点图：
c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))

plot(cvalues)（#这里的case和values是两个单纯的列名）
简化办法：
方法1：attach
将数据框名添加到搜索环境中：attach（c）,作图时就只需输入列名
attach(c)
plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach（c）
方法2：with
with(c,{

• plot(case,values)
  x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，y也就是出了with循环仍有效。
  })
  x #运行完后打印x
  附注：保存的脚本文件的格式是*.R
  思维导图：

  
  第五天思维导图.png