grep -o "bismark" SIM14-1check.txt | wc -l
while read line
do
echo $line
cat $line*"CX_report.txt" > $line"_allreport.txt" ###合并同一类型文件
done < uniqsample.txt
sort -n allsample.txt | uniq > uniqsample.txt
for file in ./*.CX_report.txt
do
short=${file##*/} ##删除前缀“##”
sample=${short%%_R_clean_1_bismark*} 删除后缀“%%”
echo $sample >> allsample.txt
done
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本文标题：Shell 命令学习
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