自10Xgenome公司收购空间转录公司，预示着单细胞的转录组未来在空间转录组，这两年来空间转录组技术一直在潜行进步着。
空间转录组研究的的必要性
研究单细胞我们想要探究细胞间的异质性，但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液，然后利用单细胞分离技术（微孔，微板，液滴）等方法实现单细胞建库，这里最大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中有很重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要，因此发展空间转录组技术实现细胞的位置信息的保留，对研究此类细胞状态尤为必要。
当前转录组存在的方法和技术
分辨率：
1、亚细胞结构
2、细胞结构
3、区域结构
当前的技术主要有四种策略：
1、基于组学实验结合空间重建的计算策略
这种计算方法可以充分利用内在基因表达模式或共表达的趋势，从单个细胞的大量转录组数据中重构细胞间的环境。然而，这些推论方法在某些情况下仅呈现空间趋势或特定组织的总体布局。
2、激光切割与NGS测序结合的策略
基于LCM的转录组学或基因组学成功地获得了单个细胞的空间转录组，尽管其通量很低，但是在可以标记成千上万个单个细胞位置的多路复用条形码策略可行之前，将少量细胞的数据粗略地整合到构成器官的巨大背景中，可能具有一定价值。
3、基于荧光物质原位的转录组学
基于图像的原位转录组学在很大程度上增加了可检测区域，但也存在一些问题，例如几种smFISH方法很难从包括信号干扰、转录本积累等复杂背景中提取单个细胞。
4、基于寡核苷酸的空间条码加上NGS测序
费用较高且无法在单个细胞中获得转录组。
空间组学可以应用的方向
1、可以鉴定到疾病的空间位置异质性
对于阿尔茨海默症的研究可以探索到小神经质细胞趋向于阿尔茨海默神经班，通过这个信息可以辅助开发激活小神经质细胞相关药物用来辅助治疗该病症。肿瘤的研究也可以及时了解肿瘤细胞的转移，特别对于浸润性肿瘤的研究。
2、建立空间转录组图谱
构建个人空间转录组图谱将极大提升科研人员对生物体器官间组织间的细胞差异。
3、描述胚胎发育及空间蓝图
胚胎发育的动态过程是科研人员一直为之着迷的，空间组学发展可以清晰的描绘胚胎发育的蓝图。
文献参考：
https://www.cell.com/trends/biotechnology/fulltext/S0167-7799(20)30140-2
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