双末端测序read2是对read1(模版链) 互补链进行测序。(将模版链切除)
其余步骤完全同read1。
PCR扩增-> 测序
数据处理
basecalling
首先获得basecalling(.bsl)文件
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basecalling 原理
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bsl文件内容
文件转化
因为bsl文件是二进制文件,并不是我们熟知的fastq文件,因此我们还需要进行文件转化。一般使用bsltofastq
。
实际读取荧光信号的操作中会利用荧光波长存在交叉的原理。(嘌呤间、嘧啶间)
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利用读取的分辨率进行判断。利用矩阵信息,解方程求解,通过各种碱基可能的概率,选择其中最有可能的结果。
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读取的强度信息
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