chapter43 双端测序与末端匹配测序

双端测序Pair-End Sequencing

缺点：
1.双端测序可能费用比单端测序高，约20%。
2.On the downside, paired-end sequencing measures the same fragment twice, hence at the same genomic coverage, it will use half as many unique fragments.个人理解是会相同测序深度，会损失一半数据，但是实际上相同样本单端和双端测序相比，只会多占用一些存储空间。

优点：
1.可以获得两端的序列，对于测序序列的首尾有特殊生物学意义的研究很重要。
2.可以减小测序误差

末端配对测序mate-pair Sequencing

和双端测序方向不同，使用的仪器很少。