本来觉得转录组上游暂时先不用学习,但是在处理原始数据时候,发现下载后,需批量处理样本,解压缩,及修改文件名。批量处理?欸,可以用LINUX,去百度了以下方法,待更新;
gunzip *.gz //解压.gz文件,并删除.gz格式的文件
继续百度探索了批量修改文件名的方案,参考linux 批量修改文件名 文件名只保留部分,去掉部分
$ for name in `ls *.CEL`;do mv $name ${name%%_*}.CEL;done
本来觉得转录组上游暂时先不用学习,但是在处理原始数据时候,发现下载后,需批量处理样本,解压缩,及修改文件名。批量处理?欸,可以用LINUX,去百度了以下方法,待更新;
gunzip *.gz //解压.gz文件,并删除.gz格式的文件
继续百度探索了批量修改文件名的方案,参考linux 批量修改文件名 文件名只保留部分,去掉部分
$ for name in `ls *.CEL`;do mv $name ${name%%_*}.CEL;done
本文标题:GEO原始数据处理
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