2022-04-25 GSVA相关

作者: 青蒿素2 | 来源:发表于2022-04-25 21:50 被阅读0次

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如果是芯片的数据是需要对数据进行过滤的，可以参考下面的测试数据代码，或者看官方的文档
GSVA本身提供了三个算法，一般使用默认的算法就可以了
对于RNA-seq的数据，如果是read count可以选择Possion分布，如果是均一化后的表达量值，可以选择默认参数高斯分布就可以了
读入的数据格式可以参考最后的表达谱数据格式，需要自己制作分组信息。

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