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科研工具 | 本地远程使用服务器的Jupyter Noteboo

科研工具 | 本地远程使用服务器的Jupyter Noteboo

作者: 与阳光共进早餐 | 来源:发表于2018-09-29 14:17 被阅读0次

    一、写在前面

    未经允许,不得转载,谢谢~~

    很久没有更新博客了ヾ(◍°∇°◍)ノ゙

    这篇主要是关于科研中对于用本地电脑远程使用服务器上面的Jupyter Notebook的配置记录。

    我们都知道Jupyter Notebook是一个很好用的交互式的代码编辑器,可以支持python、markdown等多种语言,特别是对于处理实验结果非常有帮助,但是服务器由于没有图形界面,而为了避免本地机器也要配置相关环境以及文件同步的烦恼,我们就可以配置远程使用服务器上的Jupyter Notebook,就是素有实际的程序运行都在服务器端,但界面显示在本地。

    二、具体配置过程

    1. 安装Jypyter Notebook

    • 在服务器上安装,本文用conda的方式来管理;
    • 执行指令:conda install jupyter
    • 安装完成后查看版本:jupyter --version
    • 能成功看到版本号就安装成功啦~~

    2. 生成配置文件

    • 执行指令:jupyter notebook --generate-config
    • 如下所示:


    • 可以看到配置文件的名字为:jupyter_notebook_config.py,后面需要再配置这个文件;

    3. 生成秘钥

    • 打开python3
    • 输入:
    from IPython.lib import passwd
    passwd()
    
    • 然后设置密码之后会得到一组生成的秘钥


    • 把生成的秘钥复制下来,'sha1:8ab8caa21bff:bc891ca676530bedc0dc7f7c545ae610b01e45fd'

    4. 修改默认配置文件

    • 这个时候就需要修改之前第2步中的配置文件了;
    • 在终端输入:vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py, 对文件进行编辑;
    • 在文件末尾添加以下语句:
    c.NotebookApp.ip='*'
    c.NotebookApp.password = u'sha:ce...刚才复制的那个密文'
    c.NotebookApp.open_browser = False
    c.NotebookApp.port =8889
    c.IPKernelApp.pylab = 'inline'
    
    • 其中,c.NotebookApp.port =8889中的端口号可以随意指定;

    5. 服务器端启动jupyter

    • 终端输入指令:jupyter notebook
    • 如下所示:


    • 可以看到给出的提示:
      The Jupyter Notebook is running at: http://[all ip addresses on your system]:8889/
    • 即在本地机器使用http://[all ip addresses on your system]:8889/即可访问服务器上的jupyter程序

    三、使用效果

    • 如下所示:


    • 这样每次都可以再本地打开了。
    • 使用之前会放你输入之前设置过的密码;
    • 另外运行之前需要在服务器上启动jupyter程序;

    -----------------------20181229更新---------------------

    四、 jupyter 选择conda虚拟环境

    1. 需求所在
      我们可能需要配置多个虚拟环境来运行自己的程序,那怎么样在虚拟环境在运行jupyter notebook呢~
    2. 操作步骤
      • 激活对应的虚拟环境:source activate 环境名称
      • 安装conda install ipykernel;
      • 将环境写入notebook的kernel中: python -m ipykernel install --user --name 环境名称 --display-name "Python (环境名称)"
      • 然后打开notebook:jupyter notebook
      • 然后把对应文件的kernel---> change kernel修改一下,改成刚刚配置好的。(这一步折腾了好久才发现(⊙o⊙)…)
      • 这样就可以啦

    五、参考文献

    非常感谢以下博主的文章:

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