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使用R语言展示我们生信技能树全国巡讲的征程

使用R语言展示我们生信技能树全国巡讲的征程

作者: 小洁忘了怎么分身 | 来源:发表于2019-08-15 11:25 被阅读0次

    话说有那么一天。全能打杂·小洁需要写一个全国巡讲推广软文,打开原来的推文看到这样一个路径图


    (之前做的,但是忘记该怎么做了)

    两个月过去了,又去了几个城市,图该更新了,这可咋办。向来不喜欢走回头路,于是就另寻他法了。
    胡乱搜索一下,发现R语言可以做

    直接上代码

    0.准备R包

    if(!require(devtools)) install.packages("devtools")
    library(devtools)
    if(!require("REmap")) install_github('lchiffon/REmap')
    library(REmap)
    

    1.以珠海为起点的足迹图

    options(remap.js.web=T) 
    destination<- c("重庆","济南","北京","北京","广州","上海",
                    "郑州","西安","武汉","成都","珠海","北京","杭州","长春")
    origin <- rep("珠海",times=length(destination))
    
    map_data<- data.frame(origin,destination) 
    map_out1<- remap(mapdata=map_data,        
                     title ="全国巡讲足迹",
                     subtitle ="生信技能树",
                     theme =get_theme(theme='Dark')
    )
    plot(map_out1)  
    

    超燃的!动态的!交互式的!


    2.首尾相连的路径图

    origin<-  c("珠海","重庆","济南","北京","北京","广州","上海",
                "郑州","西安","武汉","成都","珠海","北京","杭州","长春")
    
    #终点数据:
    destination<- c(origin[2:length(origin)],origin[1])
    
    map_data<- data.frame(origin,destination) 
    map_out1<- remap(mapdata=map_data,        
                     title ="全国巡讲足迹",
                     subtitle ="生信技能树",
                     theme =get_theme(theme='Dark')
    )
    plot(map_out1)  
    

    酷毙了好吗!不发朋友圈对的起自己吗?


    3.热力图

    heatmap = sampleData()
    Citys<- data.frame(city = origin,prob=sample(heatmap$prob,length(destination),replace = T)) 
    position<-get_geo_position(as.character(Citys$city )) #获取城市所在的经纬度
    map_out1<-merge(position,Citys,by = "city")
    
    remapH(title = "生信技能树全国巡讲",
           map_out1[,2:4],
           maptype = 'china',
           blurSize = 25, 
           minAlpha = 1) #数据包含3列即经度、维度、密度
    

    这个是静态的,但也挺好看的~期待以后去更多城市,为了更美好的明天而奋斗!

    4.常见问题

    (1)R包安装问题

    代码在windows上运行大多会遇到一个问题:


    我上课是提倡不要更新的,除非一直报错。先选3(不更新),紧接着library(REmap)检验是否安装成功,不成功就重新安装选择1(更新全部)吧。

    小郭同学测试过程中还遇到了这个:


    这个报错我曾讲过如何处理,就是手动删除电脑上旧包的整个文件夹,然后重装https://www.jianshu.com/p/ef81c27656c8
    经常遇到,如果你用mac 找不到安装路径,请看这里:https://www.jianshu.com/p/a9a055172188

    (2)经纬度不识别

    有可能会出现这样一个warning:

    警告信息:
    1: In get_city_coord(out_list[i], ...) : Please use your own baidu API!
    Set it using: options(remap.ak = "XXXXX")
    http://lbsyun.baidu.com
    

    然后画出这样的错误图:


    就是经纬度识别错误了,电脑本身的问题

    测试了两个windows电脑,一个刚开始能运行,后来就不识别了。另一个更惨,直接就是出现这种不识别的图。

    我的解决方案是:拿mac试试!(然后就成功了)反正不是代码的问题,API如何设置我没有搜到,放弃治疗了~

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