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为了让所有人都轻松完成「基因差异表达分析」.....

为了让所有人都轻松完成「基因差异表达分析」.....

作者: 生信石头 | 来源:发表于2022-07-20 21:53 被阅读0次

    写在前面

    在「基因差异表达」分析这件事情上,说实话,「TBtools」真的做了不少简化工作,大体如下:

    1. 做了 Rserver.plugin
    2. 做了 DESeq2 Wrapper 插件
    3. 为了确保能去运行,开发了 MetaPackageR 功能
    4. 为了让一切变得简单,做了 MetaR.plugin 模式,无需再用 MetaPackageR ,用户直接安装对应 R 插件就可以

    整完这一系列...新的问题又出现了。大体情况就是:尽管有了示例数据和文件,用户准备起文件,还是会遇到各种各样的问题。
    当然,我自己也经常忘了怎么去准备...
    于是,干脆写一个简单功能,彻底解决这个事情。

    Different Expression Analysis Prepare

    这是一个非常简单的功能,打开方式如下



    功能窗口只需要设置一个输入,建议使用直接给读段计数的 Raw Counts 矩阵,然后点击 Start



    弹出窗口简单

    分别对感兴趣的样品进行归组处理



    如此重复,可以生成各类自己需要的两两比较组合

    简单使用如下

    效果就很好

    写在最后

    有些人想不到,
    有些人看不上,
    有些人不屑,
    而时间,会给出答案。

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