conda/bioconda国内下载安装加速策略

minconda的安装与使用可参考小潤澤的推荐

• conda默认安装软件源在国外，安装速度比较慢，将其替换为国内的镜像源能大大提高下载速度。
• 方式：配置 .condarc文件

# 在/home/user目录下创建 .condarc 文件, 如果是root身份则在/root目录下
$ cd ~ 
$ vim .condarc
#在.condarc文件中写入如下内容，镜像地址放在最前，conda是从上往下寻找软件的
channels:  
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - bioconda  
  - r  
  - defaults
show_channel_urls: true

# 第一个为目前清华已有的bioconda镜像源，使用起来速度更快
# 第二个为清华conda镜像源
# 第三个为中科大的bioconda源，离清华远的地区可以将中科大的放在首位，速度更快

• 参考文章
  使用conda/bioconda 安装各种生信分析软件
  conda与bioconda解决生信软件安装困扰